Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms