Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms