Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BFSP2Q13515 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms