Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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MKRN4PQ13434 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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MKRN4PQ13434 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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MKRN4PQ13434 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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