Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
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