Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SELENBP1Q13228 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SELENBP1Q13228 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms