Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CHAF1BQ13112 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CHAF1BQ13112 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CHAF1BQ13112 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms