Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHD3Q12873 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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