Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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