Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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NFIAQ12857 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIAQ12857 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NFIAQ12857 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NFIAQ12857 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NFIAQ12857 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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