Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STX4Q12846 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms