Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms