Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms