Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms