Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms