Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RPS29P62273 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RPS29P62273 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms