Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP107P57740 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP107P57740 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP107P57740 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms