Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms