Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGDP52209 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGDP52209 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGDP52209 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms