Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT3P49368 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms