Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms