Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms