Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms