Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCAP28676 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCAP28676 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCAP28676 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCAP28676 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCAP28676 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCAP28676 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCAP28676 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms