Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms