Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms