Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms