Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRBP23467 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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