Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SPRR1BP22528 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms