Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms