Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF3P18847 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF3P18847 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF3P18847 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms