Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms