Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPCAMP16422 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms