Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME1P15531 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME1P15531 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME1P15531 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms