Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLUP10909 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLUP10909 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLUP10909 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms