Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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