Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms