Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD3P0DMS9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms