Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD2P0DJD1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms