Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSP04118 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSP04118 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms