Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VTNP04004 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VTNP04004 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VTNP04004 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VTNP04004 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms