Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOA1P02647 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms