Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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