Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX7O95931 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX7O95931 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms