Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN3O15551 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms