Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNMO15061 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNMO15061 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms