Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFKBIEO00221 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms