Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms