Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PHGR1C9JFL3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms