Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DXG7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms